Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2E2P29084 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms