Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN3P26045 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN3P26045 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms