Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRBP23467 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRBP23467 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRBP23467 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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