Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFX1P22670 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFX1P22670 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFX1P22670 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RFX1P22670 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFX1P22670 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFX1P22670 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFX1P22670 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFX1P22670 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFX1P22670 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFX1P22670 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFX1P22670 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFX1P22670 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFX1P22670 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFX1P22670 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFX1P22670 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RFX1P22670 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFX1P22670 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFX1P22670 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFX1P22670 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFX1P22670 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFX1P22670 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RFX1P22670 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RFX1P22670 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RFX1P22670 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFX1P22670 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFX1P22670 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFX1P22670 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFX1P22670 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFX1P22670 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFX1P22670 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFX1P22670 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RFX1P22670 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFX1P22670 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFX1P22670 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFX1P22670 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFX1P22670 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFX1P22670 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFX1P22670 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RFX1P22670 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFX1P22670 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFX1P22670 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFX1P22670 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFX1P22670 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFX1P22670 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFX1P22670 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFX1P22670 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFX1P22670 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFX1P22670 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RFX1P22670 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFX1P22670 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFX1P22670 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFX1P22670 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFX1P22670 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFX1P22670 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFX1P22670 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFX1P22670 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFX1P22670 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFX1P22670 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFX1P22670 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFX1P22670 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RFX1P22670 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFX1P22670 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFX1P22670 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFX1P22670 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFX1P22670 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFX1P22670 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFX1P22670 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFX1P22670 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFX1P22670 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFX1P22670 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFX1P22670 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFX1P22670 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
RFX1P22670 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RFX1P22670 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX1P22670 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX1P22670 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX1P22670 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX1P22670 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX1P22670 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX1P22670 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX1P22670 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX1P22670 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX1P22670 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX1P22670 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX1P22670 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX1P22670 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX1P22670 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX1P22670 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX1P22670 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX1P22670 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX1P22670 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX1P22670 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX1P22670 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX1P22670 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX1P22670 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX1P22670 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX1P22670 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX1P22670 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX1P22670 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms