Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCL1P22362 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCL1P22362 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCL1P22362 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL1P22362 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL1P22362 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL1P22362 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL1P22362 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL1P22362 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL1P22362 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL1P22362 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL1P22362 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL1P22362 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL1P22362 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL1P22362 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL1P22362 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL1P22362 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL1P22362 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL1P22362 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL1P22362 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL1P22362 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL1P22362 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL1P22362 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL1P22362 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL1P22362 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL1P22362 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL1P22362 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL1P22362 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL1P22362 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL1P22362 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL1P22362 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL1P22362 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL1P22362 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL1P22362 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL1P22362 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL1P22362 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL1P22362 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL1P22362 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL1P22362 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL1P22362 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL1P22362 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL1P22362 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL1P22362 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL1P22362 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL1P22362 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCL1P22362 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCL1P22362 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCL1P22362 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCL1P22362 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCL1P22362 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCL1P22362 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCL1P22362 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL1P22362 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL1P22362 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL1P22362 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL1P22362 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL1P22362 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL1P22362 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL1P22362 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL1P22362 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL1P22362 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL1P22362 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL1P22362 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL1P22362 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL1P22362 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL1P22362 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL1P22362 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL1P22362 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL1P22362 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL1P22362 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL1P22362 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL1P22362 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL1P22362 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL1P22362 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL1P22362 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL1P22362 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL1P22362 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL1P22362 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL1P22362 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL1P22362 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL1P22362 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL1P22362 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL1P22362 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL1P22362 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL1P22362 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL1P22362 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL1P22362 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL1P22362 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL1P22362 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL1P22362 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL1P22362 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL1P22362 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCL1P22362 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCL1P22362 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCL1P22362 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCL1P22362 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL1P22362 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL1P22362 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL1P22362 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL1P22362 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms