Protein–RNA interactions for Protein: P21108

PRPS1L1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1L1P21108 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPS1L1P21108 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPS1L1P21108 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.7 ms