Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCP20941 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCP20941 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCP20941 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCP20941 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCP20941 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCP20941 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCP20941 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCP20941 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCP20941 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCP20941 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCP20941 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCP20941 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCP20941 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCP20941 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCP20941 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCP20941 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCP20941 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCP20941 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCP20941 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCP20941 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCP20941 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCP20941 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCP20941 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCP20941 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCP20941 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCP20941 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCP20941 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCP20941 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCP20941 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCP20941 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCP20941 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCP20941 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCP20941 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCP20941 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCP20941 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCP20941 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCP20941 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCP20941 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCP20941 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCP20941 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCP20941 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCP20941 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCP20941 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDCP20941 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDCP20941 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCP20941 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCP20941 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCP20941 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCP20941 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCP20941 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCP20941 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCP20941 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCP20941 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCP20941 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCP20941 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCP20941 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCP20941 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCP20941 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDCP20941 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDCP20941 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCP20941 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCP20941 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCP20941 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCP20941 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCP20941 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCP20941 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCP20941 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCP20941 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCP20941 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCP20941 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDCP20941 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDCP20941 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDCP20941 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCP20941 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCP20941 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCP20941 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCP20941 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCP20941 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCP20941 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCP20941 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCP20941 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCP20941 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCP20941 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCP20941 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCP20941 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCP20941 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCP20941 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCP20941 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCP20941 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCP20941 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCP20941 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCP20941 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCP20941 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCP20941 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCP20941 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCP20941 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCP20941 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCP20941 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCP20941 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms