Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BMP3P12645 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BMP3P12645 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BMP3P12645 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BMP3P12645 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BMP3P12645 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BMP3P12645 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BMP3P12645 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BMP3P12645 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BMP3P12645 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BMP3P12645 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BMP3P12645 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BMP3P12645 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BMP3P12645 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BMP3P12645 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BMP3P12645 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BMP3P12645 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BMP3P12645 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BMP3P12645 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BMP3P12645 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BMP3P12645 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BMP3P12645 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BMP3P12645 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BMP3P12645 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BMP3P12645 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
BMP3P12645 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BMP3P12645 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BMP3P12645 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BMP3P12645 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BMP3P12645 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BMP3P12645 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BMP3P12645 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BMP3P12645 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BMP3P12645 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BMP3P12645 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BMP3P12645 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BMP3P12645 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BMP3P12645 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BMP3P12645 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BMP3P12645 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BMP3P12645 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BMP3P12645 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BMP3P12645 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BMP3P12645 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BMP3P12645 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BMP3P12645 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BMP3P12645 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BMP3P12645 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BMP3P12645 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BMP3P12645 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BMP3P12645 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BMP3P12645 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BMP3P12645 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BMP3P12645 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
BMP3P12645 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BMP3P12645 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BMP3P12645 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BMP3P12645 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BMP3P12645 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BMP3P12645 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BMP3P12645 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BMP3P12645 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BMP3P12645 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BMP3P12645 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BMP3P12645 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BMP3P12645 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BMP3P12645 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BMP3P12645 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BMP3P12645 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BMP3P12645 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BMP3P12645 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BMP3P12645 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BMP3P12645 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BMP3P12645 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BMP3P12645 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BMP3P12645 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BMP3P12645 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BMP3P12645 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BMP3P12645 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BMP3P12645 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BMP3P12645 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BMP3P12645 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BMP3P12645 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BMP3P12645 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BMP3P12645 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BMP3P12645 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BMP3P12645 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BMP3P12645 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BMP3P12645 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BMP3P12645 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BMP3P12645 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BMP3P12645 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BMP3P12645 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BMP3P12645 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BMP3P12645 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BMP3P12645 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BMP3P12645 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BMP3P12645 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BMP3P12645 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BMP3P12645 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms