Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKHD1P08F94 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms