Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2P04141 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2P04141 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2P04141 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2P04141 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2P04141 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2P04141 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2P04141 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2P04141 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2P04141 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2P04141 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2P04141 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2P04141 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2P04141 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2P04141 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2P04141 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2P04141 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2P04141 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2P04141 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2P04141 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2P04141 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2P04141 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2P04141 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2P04141 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2P04141 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2P04141 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2P04141 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2P04141 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2P04141 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2P04141 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2P04141 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2P04141 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2P04141 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2P04141 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2P04141 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2P04141 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2P04141 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2P04141 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2P04141 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2P04141 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2P04141 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2P04141 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2P04141 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2P04141 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2P04141 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2P04141 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2P04141 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2P04141 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2P04141 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2P04141 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2P04141 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2P04141 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2P04141 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2P04141 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2P04141 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2P04141 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2P04141 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2P04141 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2P04141 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2P04141 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2P04141 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2P04141 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2P04141 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2P04141 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2P04141 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2P04141 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2P04141 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2P04141 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2P04141 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2P04141 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2P04141 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2P04141 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2P04141 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2P04141 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2P04141 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2P04141 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2P04141 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2P04141 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2P04141 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2P04141 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2P04141 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2P04141 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2P04141 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2P04141 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2P04141 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2P04141 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2P04141 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2P04141 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2P04141 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2P04141 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2P04141 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2P04141 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2P04141 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2P04141 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2P04141 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2P04141 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2P04141 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2P04141 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2P04141 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2P04141 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms