Protein–RNA interactions for Protein: P01584

IL1B, Interleukin-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1BP01584 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IL1BP01584 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IL1BP01584 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IL1BP01584 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IL1BP01584 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IL1BP01584 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IL1BP01584 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IL1BP01584 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IL1BP01584 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IL1BP01584 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IL1BP01584 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL1BP01584 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL1BP01584 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL1BP01584 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL1BP01584 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL1BP01584 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL1BP01584 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL1BP01584 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL1BP01584 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL1BP01584 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL1BP01584 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL1BP01584 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL1BP01584 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IL1BP01584 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IL1BP01584 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IL1BP01584 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IL1BP01584 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IL1BP01584 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IL1BP01584 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IL1BP01584 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IL1BP01584 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IL1BP01584 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IL1BP01584 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IL1BP01584 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IL1BP01584 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IL1BP01584 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IL1BP01584 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IL1BP01584 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IL1BP01584 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IL1BP01584 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IL1BP01584 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IL1BP01584 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL1BP01584 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL1BP01584 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL1BP01584 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IL1BP01584 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL1BP01584 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL1BP01584 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL1BP01584 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL1BP01584 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL1BP01584 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IL1BP01584 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IL1BP01584 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IL1BP01584 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IL1BP01584 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IL1BP01584 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IL1BP01584 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IL1BP01584 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IL1BP01584 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IL1BP01584 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IL1BP01584 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IL1BP01584 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IL1BP01584 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IL1BP01584 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IL1BP01584 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IL1BP01584 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IL1BP01584 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IL1BP01584 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IL1BP01584 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IL1BP01584 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IL1BP01584 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IL1BP01584 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IL1BP01584 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IL1BP01584 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IL1BP01584 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL1BP01584 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL1BP01584 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL1BP01584 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL1BP01584 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL1BP01584 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL1BP01584 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IL1BP01584 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IL1BP01584 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IL1BP01584 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IL1BP01584 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IL1BP01584 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IL1BP01584 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IL1BP01584 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IL1BP01584 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IL1BP01584 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IL1BP01584 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IL1BP01584 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IL1BP01584 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IL1BP01584 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IL1BP01584 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IL1BP01584 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IL1BP01584 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IL1BP01584 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IL1BP01584 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IL1BP01584 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms