Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNCRIPO60506 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms