Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS11DO60235 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms