Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TO15178 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TO15178 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TO15178 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TO15178 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TO15178 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TO15178 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TO15178 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TO15178 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TO15178 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TO15178 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TO15178 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TO15178 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TO15178 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TO15178 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TO15178 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TO15178 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TO15178 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TO15178 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TO15178 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TO15178 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TO15178 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TO15178 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TO15178 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TO15178 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TO15178 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TO15178 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TO15178 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TO15178 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TO15178 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TO15178 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TO15178 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TO15178 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TO15178 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TO15178 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TO15178 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TO15178 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TO15178 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TO15178 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TO15178 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TO15178 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TO15178 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TO15178 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TO15178 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TO15178 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TO15178 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TO15178 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TO15178 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TO15178 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TO15178 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TO15178 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TO15178 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TO15178 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TO15178 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TO15178 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TO15178 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TO15178 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TO15178 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TO15178 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TO15178 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TO15178 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TO15178 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TO15178 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TO15178 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TO15178 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TO15178 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TO15178 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TO15178 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TO15178 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TO15178 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TO15178 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TO15178 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TO15178 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TO15178 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TO15178 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TO15178 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TO15178 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TO15178 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TO15178 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TO15178 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TO15178 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TO15178 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TO15178 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TO15178 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TO15178 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TO15178 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TO15178 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TO15178 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TO15178 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TO15178 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TO15178 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TO15178 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TO15178 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TO15178 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TO15178 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TO15178 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TO15178 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TO15178 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TO15178 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TO15178 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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