Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
N4BP3O15049 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
N4BP3O15049 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP3O15049 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms