Protein–RNA interactions for Protein: O14594

NCAN, Neurocan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCANO14594 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCANO14594 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCANO14594 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCANO14594 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCANO14594 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCANO14594 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCANO14594 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCANO14594 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCANO14594 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCANO14594 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCANO14594 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCANO14594 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCANO14594 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCANO14594 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCANO14594 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NCANO14594 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NCANO14594 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCANO14594 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCANO14594 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCANO14594 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCANO14594 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCANO14594 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCANO14594 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCANO14594 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCANO14594 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCANO14594 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCANO14594 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NCANO14594 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCANO14594 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCANO14594 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCANO14594 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCANO14594 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCANO14594 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCANO14594 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCANO14594 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCANO14594 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCANO14594 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCANO14594 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCANO14594 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCANO14594 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCANO14594 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCANO14594 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCANO14594 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCANO14594 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCANO14594 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCANO14594 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCANO14594 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCANO14594 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCANO14594 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCANO14594 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCANO14594 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCANO14594 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCANO14594 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCANO14594 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCANO14594 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCANO14594 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCANO14594 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCANO14594 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCANO14594 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCANO14594 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCANO14594 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCANO14594 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCANO14594 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCANO14594 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCANO14594 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCANO14594 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCANO14594 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCANO14594 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCANO14594 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCANO14594 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCANO14594 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCANO14594 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCANO14594 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCANO14594 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCANO14594 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCANO14594 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCANO14594 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCANO14594 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCANO14594 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCANO14594 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCANO14594 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCANO14594 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCANO14594 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCANO14594 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCANO14594 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCANO14594 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NCANO14594 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCANO14594 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCANO14594 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCANO14594 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NCANO14594 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCANO14594 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCANO14594 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCANO14594 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCANO14594 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCANO14594 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCANO14594 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NCANO14594 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCANO14594 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCANO14594 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.5 ms