Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
H7C1W4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
H7C1W4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
H7C1W4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
H7C1W4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
H7C1W4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
H7C1W4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
H7C1W4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
H7C1W4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
H7C1W4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
H7C1W4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
H7C1W4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
H7C1W4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
H7C1W4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
H7C1W4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
H7C1W4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
H7C1W4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
H7C1W4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
H7C1W4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
H7C1W4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
H7C1W4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
H7C1W4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
H7C1W4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
H7C1W4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
H7C1W4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
H7C1W4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
H7C1W4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
H7C1W4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
H7C1W4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
H7C1W4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
H7C1W4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
H7C1W4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
H7C1W4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
H7C1W4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
H7C1W4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
H7C1W4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
H7C1W4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
H7C1W4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
H7C1W4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
H7C1W4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
H7C1W4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
H7C1W4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
H7C1W4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
H7C1W4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
H7C1W4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
H7C1W4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
H7C1W4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
H7C1W4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
H7C1W4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
H7C1W4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
H7C1W4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
H7C1W4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
H7C1W4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
H7C1W4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
H7C1W4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
H7C1W4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
H7C1W4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
H7C1W4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
H7C1W4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
H7C1W4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
H7C1W4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
H7C1W4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
H7C1W4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
H7C1W4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
H7C1W4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
H7C1W4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
H7C1W4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
H7C1W4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
H7C1W4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
H7C1W4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
H7C1W4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
H7C1W4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
H7C1W4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
H7C1W4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
H7C1W4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
H7C1W4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
H7C1W4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
H7C1W4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
H7C1W4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
H7C1W4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
H7C1W4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
H7C1W4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
H7C1W4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
H7C1W4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
H7C1W4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
H7C1W4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
H7C1W4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
H7C1W4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
H7C1W4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
H7C1W4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
H7C1W4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
H7C1W4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
H7C1W4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
H7C1W4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
H7C1W4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
H7C1W4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
H7C1W4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
H7C1W4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
H7C1W4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
H7C1W4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms