Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms