Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIAS3Q9Y6X2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIAS3Q9Y6X2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.6 ms