Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARFGEF1Q9Y6D6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ARFGEF1Q9Y6D6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ARFGEF1Q9Y6D6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms