Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NOP58Q9Y2X3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NOP58Q9Y2X3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NOP58Q9Y2X3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms