Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms