Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC4AQ9UMR7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLEC4AQ9UMR7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms