Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
POLKQ9UBT6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
POLKQ9UBT6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms