Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL0

ARPP21, cAMP-regulated phosphoprotein 21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPP21Q9UBL0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARPP21Q9UBL0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARPP21Q9UBL0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARPP21Q9UBL0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms