Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFIP11Q9UBB9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TFIP11Q9UBB9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFIP11Q9UBB9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms