Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHD7Q9P2D1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms