Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS18Q9P253 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms