Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP53Q9NZM5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP53Q9NZM5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP53Q9NZM5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms