Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PODXL2Q9NZ53 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PODXL2Q9NZ53 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PODXL2Q9NZ53 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms