Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZDHHC3Q9NYG2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms