Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPLA3Q9NST1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms