Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
TOPORSQ9NS56 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOPORSQ9NS56 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 823.2 ms