Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD2Q9NRG4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms