Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASS4Q9NQ75 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms