Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM9Q9C026 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM9Q9C026 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms