Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YTHDF1Q9BYJ9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms