Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN1Q9BY11 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACSIN1Q9BY11 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms