Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VN1R3Q9BXE9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VN1R3Q9BXE9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms