Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR1

TWNK, Twinkle protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWNKQ96RR1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWNKQ96RR1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWNKQ96RR1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms