Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNAQ96QF7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms