Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SAMD8Q96LT4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMD8Q96LT4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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