Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms