Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C12orf43Q96C57 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C12orf43Q96C57 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C12orf43Q96C57 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C12orf43Q96C57 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms