Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTPBP3Q969Y2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTPBP3Q969Y2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTPBP3Q969Y2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 489.3 ms