Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC4Q8WW27 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms