Protein–RNA interactions for Protein: Q8N988

ZNF557, Zinc finger protein 557, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF557Q8N988 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF557Q8N988 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF557Q8N988 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF557Q8N988 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF557Q8N988 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF557Q8N988 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF557Q8N988 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF557Q8N988 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF557Q8N988 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF557Q8N988 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF557Q8N988 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF557Q8N988 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF557Q8N988 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF557Q8N988 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF557Q8N988 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF557Q8N988 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF557Q8N988 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF557Q8N988 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF557Q8N988 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF557Q8N988 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms