Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MSL3Q8N5Y2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSL3Q8N5Y2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms