Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NINQ8N4C6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NINQ8N4C6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 461.9 ms