Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMNTD2Q8IXW0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNTD2Q8IXW0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms